1、电源的影响
电压不稳定引起的电磁干扰会导致基本气相色谱仪的工作基线不稳定，产生基准漂移、柔软等干扰因素，影响测量结果。另外，会影响气相色谱微机系统程序，严重时温度会失去控制，燃烧光谱柱探测器加热装置。因此，员工运营时不能粗心。
一旦失去控制，就要立即关闭电源。同时，建议在基本气相色谱仪(功率为3000W)上配置功率为5000W的稳压器，使用独立电源，将确保稳压器的接地点与气相色谱仪的接地点连接起来，然后连接到画板上。
2、环境条件的影响
基础型气相色谱仪对环境温度要求不高，一般能在5 ~ 35的室温条件下正常工作。但是对环境湿度的要求一般气相色谱仪好在20%到85%的范围内。
在湿度高的地区，使用氢火焰电离探测器时，湿度大会导致放大器的绝缘性能下降，在高灵敏度屏蔽下工作时，响应值下降。
发生上述问题时，实验操作员应采取必要措施，将温度和湿度控制在实验条件允许的范围内。
气相色谱仪使用的气源纯度为99.99左右%。目前，很多教授对不同探测器使用的空气源纯度没有给予足够的注意，空气源纯度不高，传感器灵敏度下降，基线可能不稳定。
实验证明，氢的纯度低于99.99%时，热传导传感器的灵敏度不能达到3000~5000mVmL /mg。
如果将纯度为98%的氢用作氢火焰电离探测器的气体源，则氢纯度不足(包括甲烷等可燃性气体)，点燃探测器的104兆欧洲灵敏度时，基线可能会严重不稳定。好像有一个永远都出不来的彩宝棒。
因此，在选择装载机时，差不多必须严格要求，必须使装载机纯度达到99.99左右%。
