气相色谱仪工作过程中的排空气体（隔垫吹扫气、分流放空口、检测器放空口和载气），是否要接到室外，视其对室内环境及安全的影响而定，以及可燃性气体的使用，安全考虑应该是在第一位的。

采用什么样的气源，是用高压钢瓶还是气体发生器，要具体分析。一般气体厂能保证供气的质量，成本也相对较低，且实验室更换钢瓶方便，最好使用钢瓶。如果使用氢气钢瓶，应放在室外或独立气体间以确保安全；如果实验室换气频繁或者存放不方便，推荐使用气体发生器。

使用过程中，由于空气压缩机直接压缩实验室空气，要保证气体的纯化效果，首先要保证实验室的环境清洁，有些压缩机可能会把油带入气体，因此压缩空气使用前既要除水蒸气还要除有机杂质。氢气发生器和氮气发生器，要注意气相色谱仪所用试剂的纯度以及管路是否漏气，水蒸气是其主要杂质。